출산·육아휴직 급여, 세금과 4대 보험은 어떻게 처리하나요?

출산·육아휴직 급여, 세금 처리 헷갈리시죠? 2026년 인상된 급여 상한액과 1.5년 연장 제도를 반영한 인사담당자 필독 세금·4대보험 체크리스트를 확인하시죠.

Feb 24, 2026

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"우리 직원이 육아휴직을 갔는데, 회사에서 주는 보전수당에서도 세금을 떼야 합니까?" 2026년에도 이 질문은 중소기업과 스타트업 인사담당자들의 단골 고민입니다.

특히 부모 모두 육아휴직을 사용할 경우 기간이 1.5년으로 연장되고 정부 지원금 상한액이 대폭 인상되면서, 급여 관리의 복잡도는 그 어느 때보다 높아졌습니다.

잘못된 처리 한 번이 과태료는 물론, 직원과의 신뢰 관계를 해칠 수 있는 만큼 클로브AI가 2026년 최신 기준에 맞춘 명쾌한 해답을 제시해 드립니다.

1. "쉬는데 세금을 낸다고요?" 오해와 진실

휴직 기간 중 받는 돈은 '누가 지급하느냐'에 따라 세법상 성격이 완전히 달라집니다.

고용노동부(고용센터)에서 직접 근로자에게 지급하는 '출산전후휴가 급여'와 '육아휴직 급여'는 소득세법에 따라 비과세 소득으로 분류됩니다.

2026년 기준, 육아휴직 급여 상한액이 월 최대 250만 원(초기 3개월 기준)까지 인상되었으나, 이 금액은 회사가 지급하는 것이 아니므로 원천징수 대상이 아닙니다.

핵심 원칙: 고용보험법에 따른 정부 지원금 = 세금 0원

정부 지원금만으로는 부족하여 사내 규정에 따라 회사가 추가로 지급하는 급여(통상임금 차액 보전 등)는 원칙적으로 과세 대상 근로소득입니다.

따라서 인사담당자는 회사 지급분에 대해 간이세액표에 따른 원천징수를 수행하고 연말정산에 반영해야 합니다.

휴직 중에는 보수 자체가 발생하지 않거나 줄어들기 때문에 4대 보험별로 감면 또는 유예 제도를 정확히 활용해야 합니다.

무급 휴직 상태라면 '납부 예외'를 신청하여 연금보험료를 전액 내지 않을 수 있습니다.

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납부 예외 기간은 추후 연금 수령을 위한 가입 기간에 포함되지 않으므로, 근로자에게 이 점을 미리 안내하시죠.

건강보험은 납부 자체를 미루는 '유예' 신청을 합니다. 특히 육아휴직자는 복직 시 보험료를 정산하게 되는데, 이때 직장가입자 보험료 하한액을 기준으로 부과되는 경감 혜택을 받습니다.

2026년 실무 팁: 2026년 기준 건강보험료 하한액은 월 1만 원 초반 수준입니다. 대폭 경감되지만, 휴직 기간이 1.5년으로 길어진 만큼 복직 시 일시납 부담이 있을 수 있으니 분할 납부 제도를 활용하도록 안내하는 것이 좋습니다.

휴직 기간 중에는 보수가 지급되지 않으므로 보험료를 부과하지 않도록 '휴직자 명부'를 신고해야 합니다. 다만, 회사가 보전수당을 지급한다면 해당 보수액에 대해서는 보험료가 산정될 수 있습니다.

2026년은 저출산 대책 강화로 인해 실무적으로 챙겨야 할 숫자가 많아졌습니다.

여기서 고용보험 지원금은 세금을 떼지 않는다는 점이 포인트입니다.

Q1. 육아휴직 중인 직원에게 명절 상여금을 지급했습니다. 이 경우 4대 보험료를 내야 합니까?

네, 그렇습니다. 휴직 중이라도 회사에서 보수(상여금 포함)가 지급된다면 해당 금액은 과세 소득이며 고용·산재보험료 부과 대상이 됩니다.

다만 건강보험과 국민연금은 '유예' 또는 '예외' 상태라면 지급 시점에는 떼지 않고, 복직 후 정산하거나 납부 재개 시점에 반영하게 됩니다.

Q2. 2026년에 인상된 육아휴직 급여 상한액 때문에 회사 보전금 계산이 복잡해졌습니다. 계산 효율을 높이는 방법이 있을까요?

2026년 육아휴직 급여는 기간별(1~3, 4~6, 7개월 이후)로 상한액이 다르게 적용됩니다. 특히 6개월 2주(사후지급금 폐지 시점 확인 필요) 등 복잡한 구간이 많으므로 자동화된 툴을 활용하시길 권장합니다.

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