① 업종별 세금 가이드라인 - 병원, 의원

💡 이 글을 읽으면 알 수 있어요!

• 매출의 삼각지대: 보험·비보험·기타수익으로 나뉘는 병·의원만의 특수한 매출 구조 🎯

• 과세·면세 겸영: 부가세 환급과 추징을 결정짓는 매출 구분 관리의 중요성

• 인건비 리스크: 페이닥터 '넷(Net)급여' 계약 시 분쟁을 막는 실무 가이드 ✅

세금이 안정적인 업종이 아니라, '관리가 절실한' 업종입니다.

병·의원은 일반적인 자영업과는 매출 구성부터 세금 적용 방식까지 완전히 궤를 달리합니다. 진료에 집중하시느라 세무 관리를 놓치게 되면, 추후 현금영수증 미발급 가산세나 과세·면세 구분 오류로 인한 '세금 폭탄'을 맞기 쉽습니다.

병·의원 세무는 단순히 매출이 발생한 뒤 정산하는 문제가 아니라, 운영 과정 전반을 어떻게 설계하느냐에 따라 수천만 원의 차이를 만듭니다. 2026년, 안정적인 병원 경영을 위해 원장님이 반드시 체크해야 할 4가지 핵심 포인트를 정리해 드립니다 🚀

1. 병·의원 매출의 3가지 얼굴

병·의원의 매출은 그 성격에 따라 세 가지로 엄격히 구분됩니다.

주의: 모든 비보험 진료가 면세는 아닙니다. 성형수술이나 미용 목적의 시술은 건강 회복과 관련이 없으므로 부가가치세 과세 대상에 해당합니다 📉

2. 과세·면세 겸영 사업자의 숙명: 매출 구분

대부분의 병·의원은 과세와 면세를 동시에 취급하는 겸영 사업자입니다.

• 매출 구분 필수: 진료 행위는 면세지만, 미용 시술이나 병원 내 건강기능식품 판매는 과세입니다. 이를 명확히 구분하지 않으면 매입세액 공제 계산이 틀어져 환급받을 수 있는 부가세를 놓치거나, 반대로 세무조사의 빌미가 될 수 있습니다 📊

• 부가세 리스크: 매출 구분이 정확하지 않으면 매입세액 안분 계산이 틀어져 불필요한 세금을 더 내거나, 환급받아야 할 돈을 놓치게 됩니다.

3. 현금영수증 의무 발행: 10만 원의 법칙

병·의원은 대표적인 현금영수증 의무 발행 업종입니다.

• 무조건 발행: 건당 거래금액이 10만 원 이상이라면 환자가 요청하지 않아도 반드시 발행해야 합니다.

• 치명적인 가산세: 미발급 시 미발급 금액의 20%가 가산세로 부과됩니다 🛠️.

  • 예: 1억 원 누락 시 가산세 = 2,000만 원

단순 실수라 해도 금액이 매우 크기 때문에 병원 현장에서는 특히 세심한 주의가 필요합니다.

4. 인건비 처리: 페이닥터 '넷(Net)급여'의 함정

병원 비용의 큰 비중을 차지하는 인건비, 특히 페이닥터와의 계약 방식이 중요합니다.

• 넷(Net)급여란?: 세금과 4대 보험을 병원이 대신 부담하고 의사는 실수령액만 가져가는 방식입니다.

• 분쟁 방지 전략: 실무적으로는 넷급여로 협의하더라도, 근로계약서는 반드시 세전 총급여 기준으로 작성해야 합니다 ⚖️. 그래야 연말정산 환급금 귀속이나 추가 세액 부담을 둘러싼 법적 분쟁을 사전에 차단할 수 있습니다.

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